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予果生物:深耕mNGS 實現(xiàn)感染性疾病的精準診斷

從醫(yī)生手里的聽診器,到X光檢查技術(shù),再到基因檢測、宏基因組測序……隨著技術(shù)的發(fā)展,病原診斷的效率和靈敏度逐漸提升。

予果生物科技(北京)有限公司創(chuàng)始人&CEO夏涵在接受采訪時表示,“如果把傳統(tǒng)針對特定病原的檢測看成是‘釣魚’,那么宏基因組二代測序技術(shù)(mNGS)就類似于‘大面積撒網(wǎng)捕撈’。mNGS通過對臨床樣本中直接提取的DNA和/或RNA進行高通量測序,再經(jīng)過數(shù)據(jù)庫比對與生物信息學(xué)分析,可一次完成細菌、真菌、病毒和寄生蟲等多種病原體檢測,實現(xiàn)感染疾病的精準診斷。”

今年9月份,予果生物憑借病原微生物高通量基因檢測方案從全球84個國家和地區(qū)的4018個項目中脫穎而出,榮獲HICOOL 2021全球創(chuàng)業(yè)大賽一等獎。HICOOL全球創(chuàng)業(yè)大賽是以海內(nèi)外人才創(chuàng)業(yè)大賽為主體的綜合國際人才活動,大賽打通并建立了海外人才和本土人才來京創(chuàng)新創(chuàng)業(yè)的雙流通道,今年共有來自84個不同國家的5077名創(chuàng)業(yè)者報名參賽,分布在人工智能/金融科技、醫(yī)藥健康、新一代信息技術(shù)、新能源/新材料/節(jié)能環(huán)保、文化創(chuàng)意、高端裝備等六大賽道。同時,HICOOL圍繞創(chuàng)業(yè)項目“發(fā)掘-落地-孵化-融資-轉(zhuǎn)化”的普遍生命周期,自2020年起就著力構(gòu)建大賽/峰會、產(chǎn)業(yè)園、管家、基金、在線臺、商學(xué)院“六位一體”創(chuàng)新創(chuàng)業(yè)生態(tài)臺,在海外創(chuàng)業(yè)圈、投資人之間形成了廣泛影響力。

2014年全球病原診斷行業(yè)發(fā)生了一件劃時代的事件,美國UCSF團隊使用mNGS,對一位反復(fù)發(fā)燒患者的體液樣本進行基因測序并找到了感染病因,幫醫(yī)生用最常規(guī)的青霉素治愈了這位幾乎病危的患者。

“在這件劃時代的事件之后,我們團隊就在思考既然mNGS用于病原感染診斷的優(yōu)勢相當明顯,如何將宏基因組測序方法更好地標準化,最終應(yīng)用在市場廣闊的病原診斷領(lǐng)域”,夏涵說到。2017年夏涵帶領(lǐng)團隊創(chuàng)立了予果生物,成為國內(nèi)最早深耕mNGS的企業(yè)之一。

據(jù)了解,予果生物是國內(nèi)最早將游離核苷酸(cell-free)宏基因組高通量測序技術(shù)(mNGS)轉(zhuǎn)化于臨床的的企業(yè)。其自主研發(fā)的PACEseq超高維度機器學(xué)習(xí)模型,能實現(xiàn)對表型缺乏特異、病因不明的患者的鑒別,也可以對不同來源的微生物進行過濾和判斷,讓病原診斷變得更簡單,是當下最具創(chuàng)新的數(shù)字化解決方案。

當人工智能、傳感技術(shù)、云計算與大數(shù)據(jù)等技術(shù)融入醫(yī)療行業(yè),病原診斷方式也發(fā)生了升級改變,數(shù)字化的診斷方式可以快速鑒別出致病病原體,輔助醫(yī)生和患者快速明確感染病因,并對癥進行治療。

夏涵表示,“我們認為下一代的疾病診斷或者未來的疾病診斷應(yīng)該是基于數(shù)字化,因為我們在原來的模擬信號的時代已經(jīng)停留太長的時間了。”

夏涵指出,相比于傳統(tǒng)診斷模式,數(shù)字化診斷最大的差別就是獲得的數(shù)據(jù)量的大小。“宏基因組測序方法不做預(yù)先假設(shè),一次檢測結(jié)果通過與含有2萬多種病原的數(shù)據(jù)庫對比就可以獲得大量的數(shù)據(jù),大量的數(shù)據(jù)依托先進的算法和AI技術(shù),可以從海量微生物數(shù)據(jù)中提取并判斷病原微生物,進而創(chuàng)造出一種全新的病原診斷模式。”他說到。

年來,第二代基因測序技術(shù)(NGS)引領(lǐng)行業(yè)快速發(fā)展,并且由于其擁有高通量、低成本、測序時間短等諸多優(yōu)勢,至今NGS在全球測序市場中仍占據(jù)主導(dǎo)地位。

夏涵表示,“在實際臨床應(yīng)用中,宏基因組測序檢測的大量樣本中發(fā)現(xiàn)有些病原是常見的,有些病原是罕見的,但是正因為宏基因組測序可檢測出這些常規(guī)方法無法檢出的病原,醫(yī)生可參考宏基因組測序檢測結(jié)果并結(jié)合臨床表現(xiàn)對癥下藥,精準治療,使患者早日康復(fù)。”

隨著技術(shù)的進步,基因測序市場發(fā)展迅速。根據(jù)NGS(新一代基因測序)行業(yè)峰會數(shù)據(jù),我國基因測序產(chǎn)業(yè)正步入快車道,2018年全球基因測序市場規(guī)模達到102.0億美元,其中中國基因測序市場規(guī)模達到92.0億元人民,約占全球市場份額的9%-10%。去年我國基因檢測企業(yè)在一級市場中所獲融資達到193億元,相比2019年融資量,年增長率達153%。

年來,基因測序行業(yè)的迅速發(fā)展,吸引了大量資本和企業(yè)的涌入。截止2021年中予果生物已經(jīng)累計完成5.2億元融資,是mNGS賽道融資體量最大的公司,投資人囊括北極光創(chuàng)投,龍磐資本、辰德資本、創(chuàng)新工場、LYFE等該領(lǐng)域最知名機構(gòu)。

夏涵認為,“資本的進入加速了市場的發(fā)展,競爭對手的布局也讓mNGS領(lǐng)域變得熱鬧起來。但不管市場是低迷還是熱鬧,予果會一直堅守‘讓病原診斷更簡單’這個初心使命,踏踏實實去做創(chuàng)新。”

將初心化為動力,從72小時,到48小時,再到9小時……4年多來,予果生物在病原精準診斷的速度上一再取得突破。從全國各醫(yī)院送來的檢測樣本,已經(jīng)可以實現(xiàn)當天晚上11點前上機測試,讓醫(yī)生第二天一早便能根據(jù)檢測結(jié)果制定治療方案。

前不久,予果生物發(fā)布了全新病原檢測產(chǎn)品BloodSeq,檢測能遠比市場常見產(chǎn)品更快速、更靈敏、更精準。該產(chǎn)品一經(jīng)推出,受到了臨床醫(yī)生的一致好評。

“我們希望幫助更多的醫(yī)生進行快速精準的治療。”夏涵說到?,F(xiàn)在,予果生物自主研發(fā)的病原數(shù)字化檢測方案已經(jīng)在全國31個省份,150多個中心城市開展業(yè)務(wù),累計服務(wù)超1000家臨床醫(yī)院、2000個臨床科室,累計檢測樣本量10萬例,樣本總數(shù)位居全球前列,其中腦脊液檢測量位列全球第一,且增長速度非??臁?/p>

夏涵稱,予果生物今年研發(fā)投入大約有7000萬,明年還會繼續(xù)加大投入,預(yù)測到2024年之前研發(fā)投入占比都不會低于30%。予果生物目前能將生信分析和mNGS有效結(jié)合,形成較高的技術(shù)和數(shù)據(jù)壁壘。公司未來一段時間仍會專注于研發(fā),做好產(chǎn)品的升級,推動以測序技術(shù)做病原診斷市場的發(fā)展。

來源:環(huán)球網(wǎng)
編輯:GY653

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